学部
1969年04月
東京都立府中リハビリテーション学院理学療法学部として発足
1977年12月
東京都立府中リハビリテーション専門学校理学療法学科に名称変更
1986年04月
3つの都立医療系専門学校（東京都立府中リハビリテーション専門学校，東京都立新宿看護専門学校，東京都立診療放射線専門学校）を統合・改組した東京都立医療技術短期大学の理学療法学科へと移行
1998年04月
東京都立医療技術短期大学を4年制大学化した東京都立保健科学大学の理学療法学科へと移行
2005年04月
都立4大学（東京都立大学、都立科学技術大学、都立保健科学大学、都立短期大学）を統合・改組した首都大学東京健康福祉学部理学療法学科へと移行
2020年04月
東京都立大学健康福祉学部理学療法学科に名称変更
大学院
2002年04月
東京都立保健科学大学大学院保健科学研究科理学療法学専攻（修士課程）設置
2004年04月
東京都立保健科学大学大学院保健科学研究科理学療法学専攻（博士課程）設置
2005年04月
首都大学東京大学院人間健康科学研究科理学療法科学域へと移行
2020年04月
東京都立大学大学院人間健康科学研究科理学療法科学域に名称変更